Берніков відомий своїми виступами у складі харківського Металіста та донецького Шахтаря. У Харкові Станіслав опинився у 1977-му році та, з невеликою перервою, грав за "жовто-синіх" до 1983-го року. У 1979-му році опинився у Шахтарі, однак за "гірників" зіграв лише 4 поєдинки.
Після завершення кар'єри футболіста у 1991-му році впродовж кількох сезонів працював у тренерському штабі Металіста, а у 1995-му році очолював футбольний клуб "Темп" із міста Шепетівка. Цей період був недовгий в його біографії, всього з листопада 1994 року по квітень 1995 роки був головним тренером клубу «Темп» (Шепетівка). Як відомо, в ці роки розпочались проблеми у фінансуванні шепетівського клубу і він поступово скочувався до останніх сходинок.
Останнім місцем роботи Бернікова був Металург з міста Липецьк. У 2006-му році тренера звинуватили в бійці з футболістами на підґрунті підозр в організації договірних матчів. Згодом РФС прийняв рішення довічно дискваліфікувати тренера. У 2012-му році Берніков намагався оскаржити це рішення, але отримав відмову. У 2015-му дискваліфікація була скасована, але знайти себе у футболі після такого скандалу Берніков вже не зміг.